一般來講，苗木從土壤中吸收的水分主要來源于雨水、地下水及灌溉水。在北方干旱地區主要依靠灌水補充土壤中的水分。如果雨水過多或排水不暢，也會影響苗木的呼吸，嚴重的會導致爛根甚至死亡。
播種苗播種后要盡量避免表土干燥，特別是在北方地區，一些小粒種子播種后覆土較淺，易受春旱的危害。通過合理灌溉使床面保持濕潤，防止小苗失水，還可調節地表溫度，防止日灼。一般要求灌水次數多，每次灌水量要少。
扦插、壓條、埋條苗的生根、發芽都需要較大水量，特別是在剛開始展葉而尚未完全生根（即假活期）的階段，葉面蒸騰量較大，土壤水分供應量較少，一旦斷水將造成植株死亡，因此及時灌水是關鍵。在北方，氣候干燥的季節更應注意，灌水量可適當大些，但水流要細、緩，以免水流沖移動苗木（特別是扦插苗）。
分株苗、移植苗由于在栽植時根系受傷，苗木內部的水分供應出現不平衡，必須加強供水。在分株和移植后應連續灌水三四次，灌水量要大些，間隔時間也不能太長。
嫁接苗對水分的需求不是太大，只要能保證砧木的正常生命活動即可。水不能太多，尤其是接口部位不能積水，否則會使傷口腐爛。干旱天氣必須灌水時也要注意。
大苗除非在干旱季節才需灌水。如果水分過多，還會使苗木抗性降低，影響生長發育。
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